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利用宏转录组发现大量类病毒环状RNA
作者：迈其生物
来源：BioArt植物
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类病毒（Viroids） 是目前已知最小、最简单的传染因子，会导致经济作物受到重大影响【1】。类病毒是共价封闭的环状RNA分子（Covalently closed circular RNA，cccRNA） ，RNA分子大小约为220-450个核苷酸但并不编码蛋白质，RNA结构主要用于复制或者类病毒与宿主之间的相互作用。与之不同的是病毒通常会的劫持宿主的翻译系统产生病毒蛋白质，但是类病毒所利用的是宿主的转录机制。目前为止，植物中已经鉴定出约50种类病毒。
为了对类病毒以及类病毒类似物进行深度挖掘，美国国立卫生研究院Eugene V. Koonin研究组通过建立宏转录组学计算途径，发现了大量新型的类病毒类似环状RNAs，大大增加了对于类病毒这一领域的认识。相关研究成果以Mining metatranscriptomes reveals a vast world of viroid-like circular RNAs为题于2023年1月24日发表在Cell上。
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